迷宫都市勒温。这个小镇聚集了许多冒险者，那里有一个怪物出没的迷宫。失去生命又转世的主角在迷宫中醒来。怎么看都像只小猫啊！ ？然而它的真实身份却是灾难级S级怪物‘巨兽’的幼年形态！他遇见了初出茅庐的D级冒险者阿莉亚。阿丽亚误认为他是一只小猫，把他带回家，在那里他受了重伤，治疗了他，并把他当作宠物，给他起名叫“小玉”。小玉被他的善良所感动，发誓要成为一名骑士来保护阿莉亚。小玉利用她的 S 级力量与阿莉亚一起在迷宫中冒险。你作为骑士（宠物）的日子从你遇到独特的朋友并且有时被宠爱开始！
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
